Một sự cân nhắc quan trọng trong việc mua lại địa điểm là sự tồn tại của Trường Los Alamos Ranch. Bao gồm 54 tòa nhà, trong đó có 27 ngôi nhà, ký túc xá hoặc các khu khác cung cấp 46.626 foot vuông (4.331,7 m2). Các tòa nhà còn lại bao gồm một xưởng xẻ, nhà máy đá, chuồng trại, xưởng mộc, chuồng và nhà để xe, tổng cộng 29.560 foot vuông (2.746 m2). Gần Anchor Ranch có bốn căn nhà và một chuồng.[54] Công việc xây dựng được giám sát bởi Quận Kỹ sư Albuquerque đến ngày 15 tháng 3 năm 1944, Quận Kỹ sư Manhattan đảm nhận trách nhiệm.[52] Willard C. Kruger và cộng sự ở Santa Fe, New Mexico, đã tham gia với tư cách là kiến trúc sư và kỹ sư. Black & Veatch được đưa vào sử dụng để thiết kế các tiện ích vào tháng 12 năm 1945. Ban đầu được trả 743.706,68 đô la Mỹ và 164,116 đô la sau khi dự án Manhattan kết thúc vào cuối năm 1946.[55] Quận Albuquerque giám sát 9,3 triệu đô la xây dựng tại Los Alamos, và Quận Manhattan, 30,4 triệu đô la.[52] Công việc ban đầu được ký kết với Công ty M. M. Sundt ở Tucson, Arizona, với công việc bắt đầu vào tháng 12 năm 1942. Groves ban đầu đã cấp 300.000 đô la cho xây dựng, ba lần ước tính của Oppenheimer, và dự kiến hoàn thành ngày 15 tháng 3 năm 1943. Không lâu sau đó trở nên rõ ràng rằng phạm vi của Dự án Y lớn hơn nhiều so với dự kiến và đến thời điểm Sundt kết thúc vào ngày 30 tháng 11 năm 1943, đã chi hơn 7 triệu đô la.[56] Công ty Zia nhận trách nhiệm bảo trì vào tháng 4 năm 1946.[57]

Oppenheimer ban đầu ước tính rằng công việc có thể được thực hiện bởi 50 nhà khoa học và 50 kỹ thuật viên. Groves đã tăng gấp ba lần con số này lên đến 300.[56] Lượng người thực tế, bao gồm cả thành viên gia đình, khoảng 3.500 vào cuối năm 1943, 5.700 vào cuối năm 1944, 8.200 vào cuối năm 1945 và 10.000 vào cuối năm 1946.[58] Nơi ở hấp dẫn nhẩt là sáu ngôi nhà bằng gỗ và đá từng là nơi ở của hiệu trưởng, giảng viên trường Los Alamos Ranch. Chúng là những ngôi nhà duy nhất tại Los Alamos có bồn tắm, và được biết đến như là "Bathtub Row".[56][59] Oppenheimer sống ở Bathtub Row; người hàng xóm bên cạnh là thuyền trưởng William Sterling Parsons, người đứng đầu bộ phận Quân dụng và Kỹ thuật.[60] Nhà của Parsons lớn hơn một chút, vì Parsons có hai đứa con và Oppenheimer lúc đó chỉ có một.[61] Sau Bathtub Row, nơi nghỉ mát hấp dẫn nhất tiếp theo là các căn hộ được xây dựng bởi Sundt. Căn nhà hai tầng điển hình xây dựng cho bốn gia đình. Mỗi căn hộ của Sundt đều có hai hoặc ba phòng ngủ, nhà bếp với bếp lò than củi và phòng tắm nhỏ. J. E. Morgan và Sons đã cung cấp 56 căn nhà xây tự trước được gọi là "Morganville". Công ty Robert E. McKee đã xây dựng một phần của thị trấn được gọi là "McKeeville".[56] Trong tháng 6 đến tháng 10 năm 1943, và một lần nữa trong tháng 6 và tháng 7 năm 1944, số lượng người vượt quá số chỗ ở hiện có và nhân viên tạm thời phải tạm trú tại Frijoles Canyon.[62] Các căn nhà ở CEW và HEW là căn bản nhưng có tiêu chuẩn cao hơn (theo quy định của Nichols) so với các ngôi nhà ở Los Alamos (theo quy định của Groves), nhưng Nichols nói với các nhà khoa học của Los Alamos rằng nhà ở không phải là vấn đề của Groves.[63]

Giá thuê được xác định căn cứ vào thu nhập của người cư ngụ.[64] Những du khách đến Los Alamos đã được ở trong căn nhà Fuller Lodge, Guest Cottage hay Big House, từng là một phần của Trường Los Alamos Ranch.[65] Một trường được thành lập vào năm 1943, phục vụ cho cả hai cấp tiểu học và trung học, và 140 trẻ đã được ghi danh; 350 của năm 1946. Giáo dục được tự do, cũng như một trường mẫu giáo cho các bà mẹ làm việc.[66] Trường có 18 giáo viên tiểu học, 13 giáo viên trung học và một quản lý.[67] Nhiều công trình kỹ thuật đã được xây dựng. Hầu hết đều là loại bán kiên cố, sử dụng thạch cao. Họ đã được làm nóng từ một nhà máy nhiệt điện trung tâm. Ban đầu, đây là Nhà lò hơi số 1, có hai nồi hơi đốt than. Sau đó nó được thay thế bởi Nhà lò hơi số 2, trong đó có sáu nồi hơi đốt dầu. Ngoài các địa điểm chính tại Los Alamos, 25 địa điểm xa xôi đã được phát triển cho công việc thử nghiệm.[68]